Промышленность на территории, вошедшей в 1944 г. в состав Томской области, в предвоенные годы была развита слабо, основными отраслями являлись пищевая, лесная и деревообрабатывающая. В общем объеме валовой продукции 1940 г. удельный вес пищевой промышленности составлял 34.3%, лесной и деревообрабатывающей – 31.9%. Большинство промышленных предприятий, сугубо мирных предприятий местного подчинения, находилось в г. Томске. Не располагая развитой промышленностью, Томск, с первых дней Великой Отечественной войны подключился к выполнению военных заказов.
Уже через месяц после начала войны, 21 июля 1941 года бюро Томского горкома ВКП(б) утвердило «План перевода промышленных предприятий города Томска для работы на оборонные нужды». Работа всех предприятий в кратчайшие сроки была перестроена на нужды обороны. Вместо ушедших на фронт к станкам встали женщины, подростки, старики. Исходя из этого плана, фабрика карандашной дощечки приступила к производству тары под консервы и боеприпасы, а также к производству аккумуляторного шпона. Спичфабрика начала производство противотанковой зажигательной смеси, более известной как «коктейль Молотова». Предприятия местной кооперативной промышленности в полном объёме перешли на производство спецпродукции для фронта – лыжи, катушки, ружейные болванки, полушубки и их ремонт.
В годы войны лесная отрасль была подчинена нуждам обороны. На территории Томской области было отобрано и заготовлено 60 % от всех заготовок в СССР березового спецсырья для производства ружейных заготовок (ружболванки).
Леса Томской области были наиболее близкими к основным пунктам потребления древесины — шахтам Кузбасса и лесодефицитным районам Средней Азии и Казахстана. Затраты на перевозку 1 т лесопродукции из Томской области были значительно меньше, чем из Красноярского края и Иркутской области. Все это способствовало развитию лесной промышленности.
В начале Великой Отечественной войны появилась острая необходимость в эвакуации промышленности из европейской части страны. Томск стал одним из городов-акцепторов промышленности. Томск к концу 1941 года принял три десятка промышленных предприятий, 15 учреждений, 16 научно-исследовательских институтов и учебных заведений, разместил около 50 тысяч эвакуированных граждан. Помимо этого, в Томске был размещен завод «Радист» Наркомата электропромышленности (НКЭП) – № 625. Завод был эвакуирован из Ленинграда 7 августа 1941 года и в Томске функционировал как отдельное предприятие, в 1961 году сменил название на «Томский завод измерительной аппаратуры».
Известно, что в годы войны было выпущено около половины всех произведенных мин в стране, из них каждая двадцатая производилась в ИТК № 5 Томска, значит, каждая сороковая выпущенная по врагу мина в Великую Отечественную войну была сделана в посёлке Чекист, расположенном в окрестностях Томска.
Прорыв блокады Ленинграда стал поворотным моментом в истории как города, так и страны в целом. Это было по истине радостное событие, которое не обошлось без поддержи томичей: в город-герой был отправлен эшелон с пищевыми продуктами – пельмени, мясо, рыба, мёд и многое другое. При этом, другие города не были обделены вниманием, Томск снабдил станками и инструментами Воронеж, Донбасс, Сталинград, а также направил поддержку в Белоруссию.